Kaedah penulenan yang boleh digunakan untuk kolagen termasuk pengasinan, dialisis, sentrifugasi, elektroforesis, dan kromatografi, yang mana pengasinan keluar, sentrifugasi dan elektroforesis adalah yang paling biasa digunakan. Memandangkan sukar untuk diasingkan sepenuhnya dan membersihkan kolagen dengan satu kaedah, operasi sebenar adalah untuk mencapai tujuan mengasingkan dan membersihkan kolagen dengan kaedah komposit. Kaedah pengasinan biasanya menggunakan NaCl berkepekatan tinggi; kaedah sentrifugasi biasanya menggunakan ultracentrifuge suhu rendah persediaan; kaedah elektroforesis kebanyakannya menggunakan elektroforesis gel natrium dodecyl sulfate polyacrylamide (SDS-PAGE), yang boleh digunakan untuk kedua-dua kolagen. Ia juga boleh digunakan untuk menentukan jisim molekul relatif molekul kolagen. Sebagai contoh, sesetengah orang menggunakan kaedah tiga langkah penghancuran, enzimolisis dan pengasinan untuk membersihkan kolagen tulang biri-biri Sunite jenis I. Bahan bukan kolagen dalam tulang mula-mula dialih keluar, dan kemudian 10 peratus pepsin ditambahkan pada pelet, dihadam pada 4 darjah selama 24 jam dan disentrifugasi pada 14,000 r/min selama 40 minit. Buang mendakan dan tambah NaCl ke supernatan untuk membuat kepekatan akhir mencapai 0.9moL/L, biarkan ia berdiri semalaman, dan kemudian sentrifuge. Mendakan terakhir ialah kolagen jenis I.
